Řeky Estonska jsou velmi malé a ze sedmi set řek v zemi se jen devět může pochlubit překonáním hranice sto kilometrů.
Řeka Piusa
Piusa prochází územím dvou států - Estonské republiky a Ruska. Celková délka koryta řeky je devadesát tři kilometrů. Rozdělení je následující: Estonsko vlastní osmdesát kilometrů Piusa; podíl ruského území činil malých třináct kilometrů. Celková spádová oblast je 796 kilometrů čtverečních.
Pramen řeky se nachází na estonských pozemcích ve vodách jezera Alasjärv (vesnice Villa, ležící jihozápadním směrem od vesnice Vastseliina - dvanáct kilometrů). Ústí řeky je zrcadlem jezera Peipsi, nedaleko vesnice Budovizh. Na soutoku se Piusu rozděluje, vlévá se do jezera ve dvou větvích.
Střední tok řeky - osmnáct kilometrů mezi vesnicemi Vastseliina a Saetamme - vede krásnou prohlubní. Byla to ona, která se stala místem, kde byla organizována rezerva. Byla založena v roce 1965 a rozkládá se na ploše o celkové ploše přes devět kilometrů čtverečních.
Řeka Võhandu
Võhandu je nejdelší vodní cestou v republice. Jeho celková délka se rovná sto šedesáti dvěma kilometrům. Zdroj Võhandu se nachází poblíž estonské osady Saverna. Poté přejde do hlubin jezera Jiksi a dokončí cestu a spojí se s vodami Teplého jezera. K tomu dochází nedaleko vesnice Võõpsu.
Je pozoruhodné, že před jezerem Vagula obyvatelé nazývají tuto řeku Pyhajõgi, ale po jejím výstupu z jejích vod - Voo.
Plavidla plují podél řeky po úseku ohraničeném jezerem Peipsi a přístavem nacházejícím se na území vesnice Võõpsu. Hlavními dodavateli vody do Võhandu je řada toků.
Řeka Parnu
Pärnu je estonská řeka o celkové délce sto čtyřicet čtyři kilometrů. Celková spádová oblast je téměř sedm kilometrů čtverečních. Zdrojem řeky je miniaturní jezero s pramenitým původem (nedaleko od Roosno-Alliku), ale končí trasu Pärnu, vlévající se do vod zálivu Pärnus (část Rižského zálivu, baltská vodní oblast).
Řeka je krmena smíšeně. A pokud se na horním toku podzemní vody stanou dodavateli, pak na dolním toku jsou deště. Řeka v zimě ne vždy zamrzne. Pokud k tomu dojde, pak se led tvoří zhruba od druhé dekády prosince a trvá do konce března.
Řeka je splavná pouze v blízkosti místa jejího soutoku. Koryto řeky je na jedenácti místech blokováno přehradami.
