Většina řek Hondurasu je hornatá. A otevírá se seznam největších řek v celé republice - Patuka, Ulua a Aguan.
Řeka Aguan
Řeka prochází územím severního Hondurasu, začíná v oddělení Yoro. Poté se vydá na cestu, zvolí východní směr a překročí pozemky departementu Colon. A cesta končí plynutím do vod Karibského moře (poblíž Santa Rosa de Aguán). Celková délka proudu dosahuje téměř čtyř set kilometrů. Aguana má několik přítoků.
Údolí řeky se aktivně využívá v zemědělství. V údolí v horní / střední části toku se nacházejí zeleninová pole a také kukuřičné a fazolové plantáže. Údolí dolních toků je dáno rýži a citrusovým plodům. Pěstuje se zde také palma olejná a platan.
Řeka Riu-Sumpul
Rio Sumpul si razí cestu zeměmi dvou států najednou - Salvadoru (jeho severozápadní část) a Hondurasu (jihozápadní území). Řeka je velmi krátká - pouhých sedmdesát sedm kilometrů - a po celé své délce slouží jako hranice rozdělující území těchto států.
Zdroj Rio Simpul se nachází v Salvadoru. Řeka zde protíná několik obcí (všechny se nacházejí v jednom departementu - Chalatenango). Vlévá se do vod Rio Lempa.
Řeka Rio Torola
Rio Torola prochází Střední Amerikou, protéká zeměmi Salvador (severovýchod) a Honduras (jižní část republiky). Celkové trvání Rio Torola je něco málo přes sto kilometrů. Řeka má svůj původ na území Salvadoru v místě, kde se řeka Lahitas spojuje s potokem Mansukupagua. Ústí řeky Rio Torola jsou vody řeky Rio Lempa.
Řeka Ulua
Koryto řeky protíná území Hondurasu v jeho severní části, začíná na pozemcích departementu Intibuca (nedaleko La Paz, svahy hor Cordillera de Mentesillos). Celková délka proudu je 358 kilometrů s celkovou spádovou oblastí téměř třiadvacet tisíc čtverců.
Řeka je tvořena soutokem řek Sasagua a Puringla. Proti proudu je známý jako Rio Grande de Otoro. Zpočátku řeka spěchá na sever, překračuje Santa Barbaru v tranzitu, ale poté se Ulua prudce stáčí na západ a obchází tři oddělení - Yoro, Cortes a Atlantis - dokončuje cestu ve vodách Honduraského zálivu.
Řeka Goaskoran
Goaskoran prochází stezkou přes země Honduras a Salvador a prochází zeměmi v jižní části. Délka proudu je asi sto třicet kilometrů se spádovou oblastí dva tisíce šest set šedesát tři kilometrů čtverečních.
Posledních osmnáct kilometrů proudu je přirozenou hranicí mezi oběma státy. Voda Goaskoran je zdrojem pitné vody pro obyvatele země žijící na jejích březích.